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核主元分析(Kernel principal component analysis ,KPCA)在降维、特征提取以及...

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    2019-11-20 15:05
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    发表于 2020-3-18 09:56 | 只看该作者 |只看大图 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式

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    本帖最后由 Colbie 于 2020-3-18 09:58 编辑 " t3 ?) u- G- _/ l- o" S
    / W% b: R" E/ ]" U8 Q7 d) |  ^
    核主元分析(Kernel principal component analysis ,KPCA)在降维、特征提取以及故障检测中的应用。主要功能有:(1)训练数据和测试数据的非线性主元提取(降维、特征提取)
    ' Y) h8 T0 Q7 L! [+ c  z, p' |, L(2)SPE和T2统计量及其控制限的计算, G. [# p3 _5 Q
    (3)故障检测; Y. }6 o& W+ c4 ?
    + N0 g0 A3 e1 z. f0 R( j# l$ u' S
    参考文献:' Y5 G+ V$ R5 P* _1 |- @
    Lee J M, Yoo C K, Choi S W, et al. Nonlinear process monitoring using kernel principal component analysis[J]. Chemical engineering science, 2004, 59(1) : 223-234.
    $ a% o3 j% k% C/ o4 q
    6 ?" a: r' H6 e1. KPCA的建模过程(故障检测):! w9 |$ h/ \' e" m
    (1)获取训练数据(工业过程数据需要进行标准化处理)
    " R  M: g( O' I5 ^(2)计算核矩阵
    * o$ \! ^$ T8 f; ](3)核矩阵中心化
    1 ^5 E9 D4 T7 j9 i(4)特征值分解
    3 c+ l5 F( f8 i$ i(5)特征向量的标准化处理
    - Q) u/ H, b' _4 i(6)主元个数的选取& k; h# s* o! q6 o. @) l' ^6 }  a1 \3 y
    (7)计算非线性主成分(即降维结果或者特征提取结果)
    7 F0 [; S7 l8 D* X2 O3 `(8)SPE和T2统计量的控制限计算
    2 ]1 x. |4 M( c/ ^, B# f
    • function model = kpca_train(X,options)
    • % DESCRIPTION
    • % Kernel principal component analysis (KPCA)
    • %
    • %       mappedX = kpca_train(X,options)
    • %
    • % INPUT
    • %   X            Training samples (N*d)
    • %                N: number of samples
    • %                d: number of features
    • %   options      Parameters setting
    • %
    • % OUTPUT
    • %   model        KPCA model
    • %
    • %
    • % Created on 9th November, 2018, by Kepeng Qiu.
    • % number of training samples
    • L = size(X,1);
    • % Compute the kernel matrix
    • K = computeKM(X,X,options.sigma);
    • % Centralize the kernel matrix
    • unit = ones(L,L)/L;
    • K_c = K-unit*K-K*unit+unit*K*unit;
    • % Solve the eigenvalue problem
    • [V,D] = eigs(K_c/L);
    • lambda = diag(D);
    • % Normalize the eigenvalue
    • V_s = V ./ sqrt(L*lambda)';
    • % Compute the numbers of principal component
    • % Extract the nonlinear component
    • if options.type == 1 % fault detection
    •     dims = find(cumsum(lambda/sum(lambda)) >= 0.85,1, 'first');
    • else
    •     dims = options.dims;
    • end
    • mappedX  = K_c* V_s(:,1:dims) ;
    • % Store the results
    • model.mappedX =  mappedX ;
    • model.V_s = V_s;
    • model.lambda = lambda;
    • model.K_c = K_c;
    • model.L = L;
    • model.dims = dims;
    • model.X = X;
    • model.K = K;
    • model.unit = unit;
    • model.sigma = options.sigma;
    • % Compute the threshold
    • model.beta = options.beta;% corresponding probabilities
    • [SPE_limit,T2_limit] = comtupeLimit(model);
    • model.SPE_limit = SPE_limit;
    • model.T2_limit = T2_limit;
    • end
      1 U. g# r5 _2 Y

    - b$ P# E9 l# p0 @) D6 x2 y

    $ l8 D( M1 E5 B" R( j7 n2. KPCA的测试过程:% A9 D* b% |) S  u
    (1)获取测试数据(工业过程数据需要利用训练数据的均值和标准差进行标准化处理)8 B. t' w5 V4 F) _, v# f/ n/ ~
    (2)计算核矩阵& e: u$ i% S7 J% P+ ^  Y
    (3)核矩阵中心化0 Y; j7 e' Y+ a. r
    (4)计算非线性主成分(即降维结果或者特征提取结果)
    % J. r- l. W/ o- K9 Y* G8 i7 L(5)SPE和T2统计量的计算' M; p) T1 ]2 @+ a* W' e) J. M
    • function [SPE,T2,mappedY] = kpca_test(model,Y)
    • % DESCRIPTION
    • % Compute the T2 statistic, SPE statistic,and the nonlinear component of Y
    • %
    • %       [SPE,T2,mappedY] = kpca_test(model,Y)
    • %
    • % INPUT
    • %   model       KPCA model
    • %   Y           test data
    • %
    • % OUTPUT
    • %   SPE         the SPE statistic
    • %   T2          the T2 statistic
    • %   mappedY     the nonlinear component of Y
    • %
    • % Created on 9th November, 2018, by Kepeng Qiu.
    • % Compute Hotelling's T2 statistic
    • % T2 = diag(model.mappedX/diag(model.lambda(1:model.dims))*model.mappedX');
    • % the number of test samples
    • L = size(Y,1);
    • % Compute the kernel matrix
    • Kt = computeKM(Y,model.X,model.sigma );
    • % Centralize the kernel matrix
    • unit = ones(L,model.L)/model.L;
    • Kt_c = Kt-unit*model.K-Kt*model.unit+unit*model.K*model.unit;
    • % Extract the nonlinear component
    • mappedY = Kt_c*model.V_s(:,1:model.dims);
    • % Compute Hotelling's T2 statistic
    • T2 = diag(mappedY/diag(model.lambda(1:model.dims))*mappedY');
    • % Compute the squared prediction error (SPE)
    • SPE = sum((Kt_c*model.V_s).^2,2)-sum(mappedY.^2 ,2);
    • end
      7 t* H! y' {% |8 f+ w1 q

    ; i5 R! l0 X. W6 Q/ G6 r
    . @  Y  W8 m; n7 v$ `$ t( s4 t
    ; p7 J* k# G+ d8 `2 H8 u% x' C
    3. demo1: 降维、特征提取
    8 C% V! Q9 K' R: n. ~! d% B' `- [(1) 源代码
    # b/ _6 m  f$ j* h' i: W) C. L( R
    • % Demo1: dimensionality reduction or feature extraction
    • % ---------------------------------------------------------------------%
    • clc
    • clear all
    • close all
    • addpath(genpath(pwd))
    • % 4 circles
    • load circledata
    • %
    • X = circledata;
    • for i = 1:4
    •     scatter(X(1+250*(i-1):250*i,1),X(1+250*(i-1):250*i,2))
    •     hold on
    • end
    • % Parameters setting
    • options.sigma = 5;   % kernel width
    • options.dims  = 2;   % output dimension
    • options.type  = 0;   % 0:dimensionality reduction or feature extraction
    •                      % 1:fault detection
    • options.beta  = 0.9; % corresponding probabilities (for ault detection)
    • options.cpc  = 0.85; % Principal contribution rate (for ault detection)
    • % Train KPCA model
    • model = kpca_train(X,options);
    • figure
    • for i = 1:4
    •     scatter(model.mappedX(1+250*(i-1):250*i,1), ...
    •         model.mappedX(1+250*(i-1):250*i,2))
    •     hold on
    • end; O2 G- }$ U; I! E- b; ^$ H& N% T6 a

    ; x5 |3 ?" {/ y. t. }9 d; L: R

    8 h' N$ i/ j3 b+ y& H(2)结果 (分别为原图和特征提取后的图)
    ) g0 S  H: v' X1 `( {$ T

    + D9 r) i  s' |
    3 l) P: B; r9 f  D9 J, }4. demo2: 故障检测(需要调节核宽度、主元贡献率和置信度等参数来提高故障检测效果)  C7 D( [0 |2 Z
    (1)源代码- k1 J! _2 q# @0 o" E5 T
    • % Demo2: Fault detection
    • % X: training samples
    • % Y: test samples
    • % Improve the peRFormance of fault detection by adjusting parameters
    • % 1. options.sigma = 16;   % kernel width
    • % 2. options.beta          % corresponding probabilities
    • % 3. options.cpc  ;        % principal contribution rate
    • % ---------------------------------------------------------------------%
    • clc
    • clear all
    • close all
    • addpath(genpath(pwd))
    • %
    • X = rand(200,10);
    • Y = rand(100,10);
    • Y(20:40,: ) = rand(21,10)+3;
    • Y(60:80,: ) = rand(21,10)*3;
    • % Normalization (if necessary)
    • % mu = mean(X);
    • % st = std(X);
    • % X = zscore(X);
    • % Y = bsxfun(@rdivide,bsxfun(@minus,Y,mu),st);
    • % Parameters setting
    • options.sigma = 16;   % kernel width
    • options.dims  = 2;   % output dimension
    • options.type  = 1;   % 0:dimensionality reduction or feature extraction
    •                      % 1:fault detection
    • options.beta  = 0.9; % corresponding probabilities (for ault detection)
    • options.cpc  = 0.85; % principal contribution rate (for ault detection)
    • % Train KPCA model
    • model = kpca_train(X,options);
    • % Test a new sample Y (vector of matrix)
    • [SPE,T2,mappedY] = kpca_test(model,Y);
    • % Plot the result
    • plotResult(model.SPE_limit,SPE);
    • plotResult(model.T2_limit,T2);: w: U; y1 V: w, B5 g4 R9 b
    2 |  ]& U5 {  G2 @! r" V* C
    1 U" M* N7 I1 E- r, @: d1 Y  w( o
    (2)结果(分别是SPE统计量和T2统计量的结果图)' G2 q  F! a6 R8 O, ?0 W
    # a0 J" S' Q  V; }5 ]9 ?
    , F; k  M" w  x( A1 M2 C. `' f
    附件是基于KPCA的降维、特征提取和故障检测程序源代码。如有错误的地方请指出,谢谢。
    / O, L* {% ^. M& n! Z4 Y
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    5 I. Z+ x3 j$ [1 \# [4 t5 ?3 Z& l! {

    该用户从未签到

    2#
    发表于 2020-3-18 18:41 | 只看该作者
    看看楼主的代码。

    该用户从未签到

    4#
    发表于 2020-3-19 18:14 | 只看该作者
    基于KPCA的降维、特征提取和故障检测程序源代码。
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