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核主元分析(Kernel principal component analysis ,KPCA)在降维、特征提取以及...

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    发表于 2020-3-18 09:56 | 只看该作者 |只看大图 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式

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    本帖最后由 Colbie 于 2020-3-18 09:58 编辑 5 `2 \; v4 l; G# q
    $ e, ?, {1 O. z$ T- `
    核主元分析(Kernel principal component analysis ,KPCA)在降维、特征提取以及故障检测中的应用。主要功能有:(1)训练数据和测试数据的非线性主元提取(降维、特征提取)
      R0 X' [! y6 O9 k/ Q# }, c8 Q' h(2)SPE和T2统计量及其控制限的计算
    6 U/ t' ]0 H* ^, k6 U+ j(3)故障检测
    # U# [$ f% X' W4 k4 q3 }2 m- {, k" I+ w0 r* @4 I
    参考文献:
    3 A' D$ g" q: Q4 tLee J M, Yoo C K, Choi S W, et al. Nonlinear process monitoring using kernel principal component analysis[J]. Chemical engineering science, 2004, 59(1) : 223-234.
    0 I" U8 L5 Y7 U/ t. t) Q& I  K" n. ?0 E7 ?3 v/ U7 d$ E
    1. KPCA的建模过程(故障检测):
    ' [0 t9 U% Q  m(1)获取训练数据(工业过程数据需要进行标准化处理)' L1 L3 z. i& D0 c1 {
    (2)计算核矩阵
    9 n8 S! U8 B6 U( ~7 V(3)核矩阵中心化
    & E" ~) e# Q% ?8 [: P9 _+ [. N(4)特征值分解; `9 ?8 C$ h, y" H- z* F8 }
    (5)特征向量的标准化处理$ A" R* T3 A7 b, ?; ]& m# b
    (6)主元个数的选取/ w) D3 a  ^( B: w  C6 k
    (7)计算非线性主成分(即降维结果或者特征提取结果)/ v7 t) r& }2 o& e
    (8)SPE和T2统计量的控制限计算" Q4 q0 F/ k( z! d- g
    • function model = kpca_train(X,options)
    • % DESCRIPTION
    • % Kernel principal component analysis (KPCA)
    • %
    • %       mappedX = kpca_train(X,options)
    • %
    • % INPUT
    • %   X            Training samples (N*d)
    • %                N: number of samples
    • %                d: number of features
    • %   options      Parameters setting
    • %
    • % OUTPUT
    • %   model        KPCA model
    • %
    • %
    • % Created on 9th November, 2018, by Kepeng Qiu.
    • % number of training samples
    • L = size(X,1);
    • % Compute the kernel matrix
    • K = computeKM(X,X,options.sigma);
    • % Centralize the kernel matrix
    • unit = ones(L,L)/L;
    • K_c = K-unit*K-K*unit+unit*K*unit;
    • % Solve the eigenvalue problem
    • [V,D] = eigs(K_c/L);
    • lambda = diag(D);
    • % Normalize the eigenvalue
    • V_s = V ./ sqrt(L*lambda)';
    • % Compute the numbers of principal component
    • % Extract the nonlinear component
    • if options.type == 1 % fault detection
    •     dims = find(cumsum(lambda/sum(lambda)) >= 0.85,1, 'first');
    • else
    •     dims = options.dims;
    • end
    • mappedX  = K_c* V_s(:,1:dims) ;
    • % Store the results
    • model.mappedX =  mappedX ;
    • model.V_s = V_s;
    • model.lambda = lambda;
    • model.K_c = K_c;
    • model.L = L;
    • model.dims = dims;
    • model.X = X;
    • model.K = K;
    • model.unit = unit;
    • model.sigma = options.sigma;
    • % Compute the threshold
    • model.beta = options.beta;% corresponding probabilities
    • [SPE_limit,T2_limit] = comtupeLimit(model);
    • model.SPE_limit = SPE_limit;
    • model.T2_limit = T2_limit;
    • end2 U' @9 e0 _2 Q% C& N
    & _, D; M8 d$ T" M& q

    # ]/ v3 ?) q9 Y2 X2. KPCA的测试过程:
    : I( d+ R: ^; }+ }) {  @4 q0 ^(1)获取测试数据(工业过程数据需要利用训练数据的均值和标准差进行标准化处理)4 `% k- K- n1 G* y6 O+ j
    (2)计算核矩阵4 i. I* s* V$ J8 W0 `3 }+ U# C
    (3)核矩阵中心化+ J9 {# T0 z, N* P+ r& u3 x! f
    (4)计算非线性主成分(即降维结果或者特征提取结果)+ C1 m( Z: L' E5 ?
    (5)SPE和T2统计量的计算6 H1 z/ B2 S4 g# c
    • function [SPE,T2,mappedY] = kpca_test(model,Y)
    • % DESCRIPTION
    • % Compute the T2 statistic, SPE statistic,and the nonlinear component of Y
    • %
    • %       [SPE,T2,mappedY] = kpca_test(model,Y)
    • %
    • % INPUT
    • %   model       KPCA model
    • %   Y           test data
    • %
    • % OUTPUT
    • %   SPE         the SPE statistic
    • %   T2          the T2 statistic
    • %   mappedY     the nonlinear component of Y
    • %
    • % Created on 9th November, 2018, by Kepeng Qiu.
    • % Compute Hotelling's T2 statistic
    • % T2 = diag(model.mappedX/diag(model.lambda(1:model.dims))*model.mappedX');
    • % the number of test samples
    • L = size(Y,1);
    • % Compute the kernel matrix
    • Kt = computeKM(Y,model.X,model.sigma );
    • % Centralize the kernel matrix
    • unit = ones(L,model.L)/model.L;
    • Kt_c = Kt-unit*model.K-Kt*model.unit+unit*model.K*model.unit;
    • % Extract the nonlinear component
    • mappedY = Kt_c*model.V_s(:,1:model.dims);
    • % Compute Hotelling's T2 statistic
    • T2 = diag(mappedY/diag(model.lambda(1:model.dims))*mappedY');
    • % Compute the squared prediction error (SPE)
    • SPE = sum((Kt_c*model.V_s).^2,2)-sum(mappedY.^2 ,2);
    • end
      , Z1 P* P/ U8 m0 l) S
    ) y/ J7 X+ A# r; }$ b
    - S5 U9 M- V7 p
    5 a) G! q" \5 t1 V
    3. demo1: 降维、特征提取
    4 t0 u5 `* p+ k8 @6 d(1) 源代码  e% Y* |! }) T8 U* m
    • % Demo1: dimensionality reduction or feature extraction
    • % ---------------------------------------------------------------------%
    • clc
    • clear all
    • close all
    • addpath(genpath(pwd))
    • % 4 circles
    • load circledata
    • %
    • X = circledata;
    • for i = 1:4
    •     scatter(X(1+250*(i-1):250*i,1),X(1+250*(i-1):250*i,2))
    •     hold on
    • end
    • % Parameters setting
    • options.sigma = 5;   % kernel width
    • options.dims  = 2;   % output dimension
    • options.type  = 0;   % 0:dimensionality reduction or feature extraction
    •                      % 1:fault detection
    • options.beta  = 0.9; % corresponding probabilities (for ault detection)
    • options.cpc  = 0.85; % Principal contribution rate (for ault detection)
    • % Train KPCA model
    • model = kpca_train(X,options);
    • figure
    • for i = 1:4
    •     scatter(model.mappedX(1+250*(i-1):250*i,1), ...
    •         model.mappedX(1+250*(i-1):250*i,2))
    •     hold on
    • end- ]' [% J- l2 i- i2 I

    6 W- z, P8 _( x% N# C# b/ X( J
    ; K  \+ I1 }$ T. e& z" N3 W- K
    (2)结果 (分别为原图和特征提取后的图)
    6 m7 R4 J) o. @1 M5 f( f
    " C" z/ }, _  G$ g" W# H+ B
    2 N% _5 O4 M* \( w1 [
    4. demo2: 故障检测(需要调节核宽度、主元贡献率和置信度等参数来提高故障检测效果)
    : U5 g5 c7 n) ]: _5 W  v. o7 \  s(1)源代码
    7 E# t- F) Y! r1 j1 H
    • % Demo2: Fault detection
    • % X: training samples
    • % Y: test samples
    • % Improve the peRFormance of fault detection by adjusting parameters
    • % 1. options.sigma = 16;   % kernel width
    • % 2. options.beta          % corresponding probabilities
    • % 3. options.cpc  ;        % principal contribution rate
    • % ---------------------------------------------------------------------%
    • clc
    • clear all
    • close all
    • addpath(genpath(pwd))
    • %
    • X = rand(200,10);
    • Y = rand(100,10);
    • Y(20:40,: ) = rand(21,10)+3;
    • Y(60:80,: ) = rand(21,10)*3;
    • % Normalization (if necessary)
    • % mu = mean(X);
    • % st = std(X);
    • % X = zscore(X);
    • % Y = bsxfun(@rdivide,bsxfun(@minus,Y,mu),st);
    • % Parameters setting
    • options.sigma = 16;   % kernel width
    • options.dims  = 2;   % output dimension
    • options.type  = 1;   % 0:dimensionality reduction or feature extraction
    •                      % 1:fault detection
    • options.beta  = 0.9; % corresponding probabilities (for ault detection)
    • options.cpc  = 0.85; % principal contribution rate (for ault detection)
    • % Train KPCA model
    • model = kpca_train(X,options);
    • % Test a new sample Y (vector of matrix)
    • [SPE,T2,mappedY] = kpca_test(model,Y);
    • % Plot the result
    • plotResult(model.SPE_limit,SPE);
    • plotResult(model.T2_limit,T2);: B0 D5 \! w9 s8 j9 p0 k
    # g2 [) d  P3 Z3 U* W

    & c7 H2 |4 X1 F: R- l( Y(2)结果(分别是SPE统计量和T2统计量的结果图)
    ) _  ]3 t: A: B4 S0 w

    4 j6 Z& |3 E, R* a6 R% k; v" B2 C8 T
    $ a/ H8 h, z$ V3 x附件是基于KPCA的降维、特征提取和故障检测程序源代码。如有错误的地方请指出,谢谢。
    " Z/ v9 ?8 Y! _& \/ ]0 _# W
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      {; g, L1 h# w% n) p* K

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    发表于 2020-3-18 18:41 | 只看该作者
    看看楼主的代码。

    该用户从未签到

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    发表于 2020-3-19 18:14 | 只看该作者
    基于KPCA的降维、特征提取和故障检测程序源代码。
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